Parece ser un problema de configuración manual.
Por lo que veo en las salidas de las terminales, en n1 tenes en la interfaz eth0 configurada la red 2001:db8:1::/64, pero también la tenes configurada en n2 en la interfaz eth1. Está el mismo bloque en interfaces que no pertenecen al mismo segmento. En el gráfico la asignación de la red 2001:db8:1::/64 a n1 no se ve, solo se ve la 2001:db8::/64. Sí se ve en la conf. Deberías quitar esa red en n1 y ponerle una ruta que es alcanzable por n2 via 2001:db8::129.